探索Linux操作安装VASP(linuxvasp)
本文介绍了如何在Linux系统上安装VASP软件的具体步骤,给读者带来一种新的体验。
首先,我们需要在linux服务器上下载VASP软件。VASP软件(Vienna Ab initio Simulation Package)是一款由维也纳大学计算物理学实验室开发的用于模拟物理系统的计算机软件,它可以在维也纳大学网站http://www.vasp.at下载。下载后,将文件解压到任意一个文件夹中(这里假设为/VASP),之后我们就可以基于以下步骤开始安装VASP软件了。
第一步,确保系统拥有编译环境,可以使用以下命令获取:
sudo apt-get install build-essential
如果已经安装有某种版本的编译器,可以执行以下指令查看:
gcc –v
第二步,编辑VASP的全局编译文件makefile,修改里面的一些细节:
(1)在makefile中找到如下行:
CXX:= g ++
将其中的g ++改成自己当前环境中的适当的g ++编译器名称,例如Intel的编译器CXX:= icc
(2)添加如下行,确保包含头文件目录路径
INCLUDEDIR:= -I/usr/include
第三步,编辑配置文件make.inc,填写一些必要的系统信息:
(1)代码的编译模式
编辑ARCH变量,根据系统架构填写适当的内容,如Intel系列处理器需要填写 ”Intel” 或是 ”intel-mkl”
(2)你想要编译的VASP版本
编辑CODE变量,其可能的取值有 ”VASP_STD” 和 ”VASP_GAMMA”,如果你不想使用任何特殊编译选项,只需填写 ”VASP_STD”就可以了。
(3)软件所使用的包
编辑PACKAGES 变量,可以用它来指定依赖的第三方工具库或包,具体看你需要安装哪些功能,并按照正确的格式填写。有时候这些包列表的文件会比较大,需要把它们拆分成几个小文件,然后把这几个小文件 包含在编译配置文件里面。
第四步,编译源码并生成bin文件夹
现在,我们可以执行以下命令来编译VASP源文件了:
make
编译完成后,如果一切顺利,你会在VASP目录下看到一个bin文件夹,里面就是我们的VASP可执行文件。如果遇到任何编译错误,可以将错误信息发送给相关客服,他们会尽快给你解决。
最后,我们需要让 VASP 可执行的 bin 文件夹变得可用,也就是说,把这些可执行文件放到系统可以查找到的地方,可以使用以下命令:
sudo cp -r bin/ ~/.local/bin/
这样,我们就完成了在linux系统上安装VASP软件了,是不是很简单呢?
通过上述步骤,读者可以掌握如何安装VASP软件,为今后的项目做准备。此外,读者也可以灵活的修改和拓展VASP的功能,构建属于自己的个性化解决方案。