有关qsub在Linux下的使用指南 (qsub linux)

在Linux环境下，有许多工具和命令可用于提升工作效率和计算速度。其中，qsub是一款使用广泛的命令行工具，可帮助用户将计算任务提交到集群系统中进行处理。本文将介绍qsub在Linux下的具体使用指南，帮助读者更好地掌握和使用该工具。

一、qsub的基本介绍

qsub全称为”Queue Submitter”，是Sun Grid Engine (SGE)集群管理软件中的一个命令行工具。它的主要作用是将用户提交的任务加入到队列中，等待计算节点执行。qsub可在Unix/Linux等操作系统下使用，是高性能计算集群中提交任务的标准方式之一。

二、qsub的安装与配置

如果您的系统中已经安装了SGE集群管理软件，则qsub命令已经包含在其中。如果没有安装，可以通过以下命令进行安装：

sudo apt-get install gridengine-client

安装完成后，需要进行相关配置。具体步骤如下：

1. 配置集群管理器

在集群中安装SGE集群管理软件后，需要执行以下命令来配置SGE：

sudo /usr/share/gridengine/util/install_modules/install_modules_local

安装完成后，需要启动SGE服务：

sudo service gridengine-master start

2. 配置qsub

安装完SGE集群管理软件后，可以使用qsub命令来执行计算任务。在使用qsub之前，需要进行以下配置：

（1）创建一个工作目录，在其中创建一个脚本文件。脚本文件中包含要执行的命令和参数。

（2）在脚本文件的开头写入#!/bin/bash，表示这是一个shell脚本。

（3）在脚本文件中添加作业控制参数，如#BSUB命令、#PBS命令等。

（4）将脚本文件命名为job.sh并保存在工作目录中。

（5）使用qsub命令将任务提交到集群系统中。

三、qsub的使用

1. 命令格式

qsub [-ACdfklmnpqtTv] [-@ 条件] [-a 开始时间] [-A 账户] [-b y/n] [-c n] [-C 目录] [-cwd] [-e 错误文件] [-h] [-I] [-j y/n] [-js 脚本] [-l 资源] [-m y/n] [-M 邮件地址] [-N 作业名称] [-o 输出文件] [-p 优先级] [-P 项目] [-r y/n] [-S 解释器] [-u 用户] [-v 环境变量] [-V] [-w 类型] [-W 等待时间] [-x] [脚本]

2. 常用参数

（1）-l 资源：指定作业执行要求的资源，如使用节点数、CPU数量、内存大小等。

（2）-N 作业名称：指定作业的名称，方便管理和查找。

（3）-o 输出文件：指定标准输出文件的名称。

（4）-e 错误文件：指定标准错误输出文件的名称。

（5）-p 优先级：指定作业执行的优先级。

（6）-q 主机名：指定要使用的计算节点。

（7）-S 解释器：指定作业使用的解释器。

（8）-V：将环境变量传递给脚本中的程序。

四、qsub的示例

下面给出一个qsub的使用示例，该示例中，我们将使用qsub命令将一个简单的程序提交到集群系统中执行。

1. 创建一个工作目录，将以下脚本保存为job.sh：

#!/bin/bash

#$ -N test

#$ -cwd

#$ -l nodes=1:ppn=8

echo “hello, world!”

以上脚本表示，我们将创建一个名为test的作业，要求使用1个节点和8个CPU核心，使用默认的工作目录并输出”hello, world!”。

2. 使用qsub命令提交作业并查看执行结果：

qsub job.sh

qstat -u [username]

以上命令将作业提交到集群系统中，并使用qstat查看执行结果。如果作业执行成功，将在标准输出文件中输出”hello, world!”。

五、

通过本文的学习，我们了解了qsub在Linux环境下的相关知识和使用指南。在实际工作中，qsub将为用户提供便捷的计算任务提交方式，极大地提高了工作效率和计算速度。希望读者们能够深刻理解并掌握qsub命令的使用方法，从而更好地利用Linux环境中的优秀工具。