Linux下MPI安装指南(linux安装mpi)
Linux是一个多用户开放源码/多任务操作系统,软件由内核和应用程序组成,其中包括MPI。MPI是一种通用编程模型,可支持分布式并行计算,在生物信息分析,深度学习等研究中得到了广泛应用。本文将介绍 Linux 下安装 MPI 的步骤。
### 一、准备工作:
1. 首先,下载并安装 gcc 和 gfortran 编译器。在终端中运行以下命令:
“`shell
sudo apt-get install gcc
sudo apt-get install gfortran
2. 配置内核参数(可选):在 Linux 终端中运行以下命令:
```shellecho 'kernel.shmmax=2147483648' >> /etc/sysctl.conf
sysctl -p
上述命令将内核共享内存最大值设置为2GB,这是 MPI 分布式计算的需要。
### 二、安装 MPI:
1. 下载 MPI:进入官网 http://www.open-mpi.org/,下载最新的 Linux 版本的 MPI, 下载完成后,将其解压缩到指定路径,此处以文件夹 /mnt/mpi 为例:
“`shell
cd ~/
tar -zxvf openmpi-3.1.3.tar.gz -C /mnt/mpi
2. 编译 MPI:
使用 gcc 和 gfortran 编译 MPI 源代码。在终端中运行以下命令:
```shellcd /mnt/mpi/openmpi-3.1.3
./configure FC=/usr/bin/gfortran CC=/usr/bin/gcc CXX=/usr/bin/g++make
make install
3. 配置环境变量:在 .bashrc 文件中添加以下内容:
“`shell
export PATH=$PATH:/usr/local/openmpi-4.0.5/bin
export LD_LIBARAY_PATH=$LD_LIBARAY_PATH:/usr/local/openmpi-4.0.5/lib
### 三、检验 MPI 安装:
1. 检查 MPI 版本:在终端中运行以下命令:
```shellmpirun --version
2. 运行测试程序:假设当前工作目录下有 helloword.c 文件,以下命令可以构建并运行这个程序:
“`shell
mpicc helloworld.c
mpirun -np 4 ./a.out
以上命令将构建和运行 helloworld 程序,输出结果中会显示各个进程ID和节点名称,代表 MPI 安装成功。
综上所述,Linux 下安装 MPI 的步骤主要包括准备工作,安装 MPI,以及检验 MPI 安装。通过以上步骤,开发者可以顺利地完成 Linux 下 MPI 的安装工作,使用 MPI 进行分布式并行计算。